Начальник Головного управління ДФС у Херсонській області, Автономній Республіці Крим та м. Севастополі – Клим Ігор Вікторович

1. Управління організації роботи;

2. Сектор охорони державної таємниці, технічного та криптографічного захисту інформації;

3. Управління по роботі з персоналом;

4. Управління моніторингу доходів та обліково-звітних систем;

5. Юридичне управління;

6. Сектор з питань запобігання та виявлення корупції;

7. Відділ комунікацій;

8. Новокаховське управління;

9. Херсонське управління;

10. Бериславське управління;

11. Великолепетиське управління;

12. Генічеське управління.

Перший заступник начальника Головного управління ДФС у Херсонській області, Автономній Республіці Крим та м. Севастополі – Сосинович Дмитро Олександрович

1. Відділ боротьби з відмиванням доходів, одержаних злочинним шляхом;

2. Оперативне управління;

3. Слідче управління фінансових розслідувань.

4. Філія Державного підприємства "Сервісно – видавничий центр" у Херсонській області (у процесі взаємодії).

Заступник начальника Головного управління ДФС у Херсонській області, Автономній Республіці Крим та м. Севастополі – Невдах Наталія Миколаївна

1. Управління обслуговування платників;

2. Управління податків і зборів з юридичних осіб;

3. Управління податків і зборів з фізичних осіб;

4. Управління аудиту.

Заступник начальника Головного управління ДФС у Херсонській області, Автономній Республіці Крим та м. Севастополі – Квасневський Микола Анатолійович

1. Управління матеріального забезпечення та розвитку інфраструктури;

2. Управління фінансування, бухгалтерського обліку та звітності;

3. Управління інформаційних технологій;

4. Управління погашення боргу;

5. Управління контролю за обігом та оподаткуванням підакцизних товарів.

6. Відділ реєстрації користувачів при ГУ ДФС у Херсонській області управління (центру) сертифікації ключів Інформаційно – довідкового департаменту ДФС (у процесі взаємодії).